Wellcome Sanger研究所利用NVIDIA加速计算推进癌症研究
realtime news Sep 24, 2024 11:11
Wellcome Sanger研究所利用NVIDIA的加速计算技术来增强癌症基因组分析，大幅降低成本和能源消耗。
根据NVIDIA博客的公告，Wellcome Sanger研究所是人类基因组计划的重要贡献者，现正利用NVIDIA的加速计算技术来增强其癌症研究工作。
加速基因组分析
该研究所位于英国，运营着世界上最大的测序设施之一，已读取超过48拍贝的DNA和RNA序列。这些广泛的数据收集有助于理解健康和疾病的机制。特别是，该研究所的癌症、衰老和体细胞突变（CASM）项目每年测序和分析数万个癌症基因组，以研究突变过程和治疗效果。
为了管理这些大型项目，Wellcome Sanger研究所正在探索使用NVIDIA DGX系统和NVIDIA Parabricks，这是一套利用加速计算来高效处理数据的基因组分析软件。CASM项目的首席软件开发者Jingwei Wang指出，NVIDIA的解决方案将节省大量时间、成本和能源，使研究所能够更有效地处理数十万个体细胞样本。
减少运行时间和能源消耗
该研究所已开发出基因组功能筛选和药物测试的高通量模型。通过整合NVIDIA加速计算和软件，它显著减少了每个基因组的运行时间和能源消耗。具体来说，在NVIDIA GPU上使用Burrows-Wheeler Aligner（BWA）与Parabricks相结合，与使用128个双插座CPU服务器相比，运行时间减少了1.6倍，成本减少了24倍，能源消耗减少了42倍。
每年研究所大约消耗1.25亿CPU小时来测序1万个基因组。通过切换到GPU上的BWA与Parabricks，研究所每年可节省约100万美元和1,000兆瓦时的能源，相当于为一个普通美国家庭供能一个世纪所需的能源。
与行业领导者合作
Sanger研究所的NVIDIA加速测序实验室称作AI工厂，在这里数据被转化为可操作的情报。这个AI工厂模型利用全栈加速计算平台来处理计算密集型任务。
该研究所与电力管理和自动化领域的专家Schneider Electric合作，优化数据中心的设计以实现能源效率和高性能。Schneider Electric以其在能源管理和自动化方面的专业知识闻名，协助减少数据中心停机时间，并为DNA测序实验室配备不间断电源和先进的冷却系统等必要技术。
在NVIDIA GTC 会议期间，Schneider Electric 宣布发布为NVIDIA加速计算集群定制的AI数据中心参考设计。这些设计旨在增强数据处理、工程仿真、电子设计自动化、计算机辅助药物设计和生成式AI，重点放在高功率分配和液冷系统上。
本周，来自Wellcome Sanger研究所、Schneider Electric和NVIDIA的代表将在The Economist主办的纽约气候周座谈会上讨论他们的合作努力。
欲了解更多信息，请访问 NVIDIA博客。
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